柴油發電機組在運行的時候，機油必須在發動機內不斷地被過濾和清潔，而這一項將由機油濾清器來完成，機油濾清器可去除機油中的灰塵、金屬顆粒、碳沉淀物和煤煙顆粒等雜質，以保護發動機，目前柴油發電機組有兩種機油過濾系統：全流式系統和旁通式系統。
柴油發電機組
旁通式濾清器
采用旁通式濾清器的柴油發電機組在運行時大約90%的機油被直接泵到發動機，僅約10%的機油被送到機油濾清器來過濾。如果該濾清器堵塞，則會賣到所有機油均無法被過濾，機油將會在沒有任何過濾的情況下被加壓送入發動機。
全流式濾清器
在全流式系統中，所有機油在進入發動機前都必須穿過機油濾清器。如果雜質堵塞了機油濾清器，濾清器前的機油壓力將升高，從而導致卸壓閥打開。在濾清器前后的壓力差約為5~40psi時，卸壓閥打開，這稱為差壓，差壓是濾清器的進口和出口之間的壓力差。進口壓力始終由壓力調節閥控制著，當機油濾清器使用一段時間后堵塞時，濾清器的另一側的壓力將降低，當壓差等于卸壓閥的設置時，一定量的機油將穿過濾清器，進入發動機。這意味著即使濾清器阻塞了，發動機仍能得到機油。如果濾清器被完全堵塞了，那么機油壓力會稍微低于正常的壓力。
在技術發展比較落后的以前，柴油發電機組只使用旁通式系統，隨著技術的提高，以及過濾發動機機油的需求量加大，現在的機組使用的均是全流式系統。機油濾清器要定期更換，如果是新機組，在首次工作50小時后便要更換一次機油濾清器，之后一般是200小時更換一次，但是由于機組使用環境及使用時間的不同，更換周期也會有所不同，具體可咨詢專業發電機廠家。